系统脱盐率是反渗透系统对盐的整体脱除率，它受到温度、离子种类、回收率、膜种类以及其他各种设计因素的影响，因而不同的反渗透系统的系统脱盐率是不一样的，其计算公式为
系统脱盐率=（总的给水含盐量-总的产水含盐量）/总的给水含盐量×100％
有时出于方便的原因，也可以用下列公式来近似估算系统脱盐率
以此近似估算得到的系统脱盐率往往低于实际
3868la银河总站系统脱盐率，因此经常在反渗透系统验收时引起争议。
膜元件的标准脱盐率、实际脱盐率与系统脱盐率
膜元件标准脱盐率为膜元件生产厂家在标准条件下所测得的脱盐率，以某公司的低压系列产品为例，其CPA2产品在标准条件下的最低脱盐率为99．2％（平 均脱盐率为99．5％），其CPA3产品在标准条件下的最低脱盐率为99．6％（平均脱盐率为99．7％）。
膜元件实际脱盐率为膜元件在实际使用时所表现出来的脱盐率，实际脱盐率会比标准脱盐率高，但更多情况下要比标准脱盐率要低这是由于标准测试条件与实际使用条件完全不同，在标准测试条件下，其标准测试溶液为氯化钠溶液，膜元件标准脱盐率表现为对氯化钠的脱除率，在实际使用条件下，由于水中各种离子成分不同，温度、平均水通量选取值、系统回收率等均不同于白欧洲测试条件，而这些因素均会影响到膜元件的脱盐率。
系统脱盐率为整套
3868la银河总站装置所表现出来的脱盐率，同样由于使用条件与标准条件不同，系统脱盐率有别于标准脱盐率，同时由于反渗透装置一般均串联多根膜元件，而装置中每根膜元件的实际使用条件均不同，故系统脱盐率也有别于膜元件实际脱盐率，对于只有1根膜元件的装 置，系统脱盐率才等于膜元件实际脱盐率。
要预测系统脱盐率的最简单的办法就是通过膜元件生产厂家的计算软件进行实际计算。
了解了膜元件的标准脱盐率、实际脱盐率与系统脱盐率之间的关系之后，在设计反渗透装置、给用户提供系统性能担保、验收反渗透装置或者评定膜元件性能时，一定要根据系统实际脱盐率来进行，而不能以膜元件标准脱盐率来进行。
